В "Звездном пути 3: В поисках Спока" капитан Джеймс Т. Керк сталкивается с тем, что победы над Ханом и создание планеты Генезис лишь временно приносят радость. Керк потерял Спока, своего лучшего друга, который погиб, спасая "Энтерпрайз". Эта утрата стала тяжелым испытанием, и победы уже не кажутся такими важными.

Ситуация осложняется, когда доктор Мак-Кой, друг и член экипажа "Энтерпрайз", теряет рассудок. Неожиданный визит Зарека, отца Спока, раскрывает тайну — разум Спока был перенесен в тело Мак-Коя. Керку открывается шанс вернуть друга к жизни, и он решает рискнуть всем ради этой возможности.

Керк угоняет свой старый корабль, который уже приговорен к слому, нарушая установленный Федерацией карантин на планете Генезис, где работает научная экспедиция под руководством его сына Дэвида. Однако, когда Клингоны узнают о существовании Генезиса, начинается гонка со временем. Крюге, командир Клингонского боевого корабля, направляется к планете с собственными планами. Столкновение этих сил станет неизбежным, и судьба Генезиса висит на волоске.