Фильм переносит зрителя в последние дни Второй мировой войны, где пилот-камикадзе Коити Сикисима вынужден совершить аварийную посадку на острове Одо. Ночью солдат внезапно атакует загадочное существо — Годзилла, легендарный монстр, о котором ходят жуткие слухи среди местных жителей.

Спустя годы, когда война остается позади, Коити возвращается в разрушенный Токио и берется за опасную работу по обезвреживанию морских мин. В его жизни появляется молодая женщина с младенцем, потерявшая семью в хаосе послевоенных лет. Однако судьба не дает ему покоя — вскоре он снова встречает Годзиллу, ставшего еще более смертоносным после ядерных испытаний. Эта схватка определит не только его судьбу, но и будущее целого поколения.