Фильм "Логово" переносит зрителя в 2017 год, когда британская летчица Кейт Синклер была сбита над вражеской территорией в Афганистане. Оставшись в одиночестве и окруженная врагами, она находит временное убежище в заброшенном бункере, который оказывается научно-исследовательской лабораторией, заполненной кровожадными монстрами. После того как одно из существ сбегает, Кейт, едва уцелев, попадает в руки американских военных, которые доставляют ее в форт Апачи. Там ее слова о монстрах встречаются с недоверием, и ей приходится искать помощи среди враждебных подразделений. В это время внутри лаборатории существо продолжает свою кровавую охоту, угрожая не только жизни Кейт, но и всех, кто окажется на его пути.